При проведении лечения от бесплодия методом ИКСИ этапы не отличаются от экстракорпорального оплодотворения: суперовуляция, подготовка спермы и яйцеклеток, пункция фолликулов. К самой процедуре преступают непосредственно после того как с яйцеклетки снимается кумулюс.